从东莞南到香港西九龙，您可以按照以下步骤过关：

1. 准备必要的文件：确保您携带有效的护照和有效签证（如需要）。

2. 前往深圳湾口岸：从东莞南乘坐交通工具前往深圳湾口岸。您可以选择乘坐长途客车、出租车或自驾车，根据您的个人喜好和出行需求选择合适的交通方式。

3. 边检和海关检查：到达深圳湾口岸后，您需要进入边检和海关检查区域。请按照指示排队等候，提交您的护照和其他必要的文件进行检查。

4. 过关程序：根据边检和海关人员的要求，您可能需要进行指纹采集、填写入境卡等程序。请确保您按照要求提供准确的信息和配合工作人员的指引。

5. 乘坐交通工具：完成海关和边检程序后，您可以根据需要选择合适的交通工具前往香港西九龙。在深圳湾口岸有巴士和出租车等交通工具可供选择。

请注意，具体的过关流程可能会因政策和要求的变化而有所调整，请您提前了解最新的入境政策和要求，并根据情况进行准备和安排。