在于其所违反的法规不同。
无证经营是指经营者没有取得相关的行政许可证件，例如没有工商营业执照；而无照经营是指经营者没有按照要求向相关部门进行备案登记，例如没有食品经营许可证。
区别在于是否取得前置许可证或后置许可。无照经营是指没有取得营业执照就开展经营的违法行为。无证经营是指已取得营业执照，但未取得经营许可证而开展经营的行为。比如已经取得加油站营业执照，但未取得汽油零售许可证就开始卖油，属于无证经营。
根据《食品安全法》第八十四条的规定，无证照从事食品经营活动的，由工商行政管理部门没收违法所得、违法经营的食品和用于违法经营的工具、设备等物品，违法经营的食品货值金额不足1万元的，并处2000元以上5万元以下的罚款;货值金额1万元以上的，并处货值金额5倍以上10倍以下的罚款。