医疗机构许可证和营业执照是不一样的，不可相互替代。针对行业不同，营业执照办理人群为各个行业，而医疗机构执业许可证办理人群只针对医疗行业。营业执照和执业许可证都是行政许可。所有经营主体都得取得营业执照。如果从事医疗服务，还要取得执业许可证。医院的营业执照和别的工商营业执照是不一样的，不同于其它的工商营业执照。
1. 开设医院前，需在当地卫生和计划生育委员会（或卫生局）申请新办医疗机构许可证。
2. 取得人民政府相关行政部门（如卫生、商务、工商、税务等）的核实和批准。
3. 提交医疗机构执业许可证所需的资料和证明，如医师执业证、执业护士证、身份证、学历证书等。
4. 提交医疗机构财务方面的证明，如纳税证明、社保证明、法定代表人信用证明等。
5. 在卫生、商务、工商、税务等部门进行注册，获得各项证照，如医疗机构执业许可证、工商营业执照、税务登记证、组织机构代码证等。